La crème fraîche est un aliment très périssable, sauf lorsqu’elle est dans un emballage stérile et qu’elle a été pasteurisée et stérilisée ou traitée à haute température (UHT). Comme le lait, elle constitue un milieu privilégié au développement de bactéries et elle s’altère quand elle est exposée à la chaleur et à la lumière. La conserver au réfrigérateur, il s’agit alors de la consommer avant la date de péremption. La crème UHT non entamée se conserve jusqu’à 45 jours à la température de la pièce. Entamée, elle est aussi périssable que les autres produits laitiers et doit être réfrigérée. Conserver la crème fouettée au réfrigérateur. elle gardera sa consistance quelques heures. Il n’est pas recommandé de congeler la crème car sa texture a tendance alors à devenir granuleuse et sa saveur se modifie. De plus, il est impossible de la fouetter par la suite.